Se recomienda el uso del agua de peptona para estudiar la capacidad de un microorganismo de fermentar un carbohidrato específico que facilite la diferenciación de géneros y especies. El agua de peptona, ajustada a un pH de 8,4, es apta para el cultivo y el enriquecimiento de Vibrio cholerae procedente de material infectado.
El agua de peptona se puede modificar para su uso en pruebas de fermentación de carbohidratos mediante la incorporación del indicador de Andrade.